Det drejer sig om afgangene fra Gedser i aften 20.15, 22.30 og 01.45 samt afgangene fra Rostock 20.15, 22.30 og 04.15 tirsdag morgen.
Det oplyser Scandlines.
Rederiet forventer at genoptage færgedriften på Gedser-Rostock tirsdag morgen.
Driften på Rødby-Puttgarden er ikke påvirket af stormvejret.
Kunder med billet til Gedser-Rostock kan uden ekstra omkostninger anvende billetten på Rødby-Puttgarden, oplyser Scandlines.